咸阳市卫生局机关编制27名，其中局领导9名。内设秘书科、人事科、医政科、卫生执法与监督科、爱卫办、干部保健科、监察室、新合疗办公室共8个科室。各科室主要职责如下：
    1、秘书科：负责编制全市医疗卫生单位基本建设、装备计划、研究拟订卫生“三项”建设规划和年度计划，并监督实施；负责机关行政、后勤、财务、财产等事务性管理和接待、信访等工作。
    办公室电话：33550815（值班、传真）  33550813   科室负责人：张自治  马宁强
    2、人事科：协助主管部门负责卫生专业技术职务评定管理工作，负责职称考试报名及考务、发证等组织工作；负责局机关和直属单位人事、劳动就业、工资福利管理及离退休职工的服务工作。
    办公室电话：33550817  科室负责人：尚惠霞   梁  昕
    3、医政科：负责组织卫生执业资格医师考试报名、考务及发证工作；监督医疗机构的医疗质量和服务质量；对全市医疗纠纷、事故案件进行调查鉴定和处理；负责医学卫生职业教育和医学成人教育的管理工作，指导临床进修学习工作；负责调控监督管理医疗市场、网点建设、机构规模、业务活动和个体开业行医者的管理工作；负责医疗机构的广告宣传和抢险救灾医疗救护的组织工作。
    办公室电话：33550819  科室负责人：马  剑  刘维晓
    4、卫生执法与监督科：负责对从事生产经营食品、化妆品的单位进行管理监督；组织对突发疫情、病情实施紧急处置；负责卫生行政复议和卫生执法监督。监督管理食品、职业、环境、学校、放射卫生和计划免疫管理工作；负责急性、慢性传染病和寄生虫病的防治控制工作；负责地方病的防治管理和农村卫生工作，实施初级卫生保健。
    办公室电话：33550820  科室负责人：魏奇军    张梅英
    5、爱卫办：负责组织除“四害”防病活动，协调监督有关部门改善农村饮水条件和环境卫生；进行城乡社会性公共卫生管理和监督、检查、评比。
    办公地点：市政府大院西楼三层
    办公室电话：33210484  科室负责人：马一晔   刘  涛
    6、监察室：负责全市卫生系统行风建设，组织开展精神文明“创建选优评差”竞赛活动；监督查处局直单位违反党、政纪律规定的人和事；组织全市药品集中招标采购工作。
    办公室电话：33550823  科室负责人：张永芳

7、干部保健科：制定全市干部保健工作计划，组织对保健对象体检、健康教育、预防接种和医疗巡诊等；对担任干部保健医院建设和管理进行督促检查，协调解决干部保健工作中存在的困难和问题，指导县区干部保健工作；建立市级干部保健对象、保健健康专家和医务人员信息库，做好保健对象的医疗保密工作；承办市保健委员会办公室日常工作。

办公室电话：33550821  科室负责人：黄永科

8、新合疗办：贯彻执行国家和省市有关新型农村合作医疗制度的政策规定，拟定全市新型农村合作医疗制度实施方案并组织实施，指导、督查市县区新型农村合作医疗制度的政策执行情况，做好信息统计和反馈工作，承担市新型农村合作医疗试点工作领导小组办公室日常工作。

办公室电话：33550822  科室负责人：池军文